ok la primera pregunta seria... le quieres agregar los subs despues de haber hecho la compresion?
el convert siempre te va a partir el capitulo en 2 por que solo se pueden tener archivos de 1gb si el capitulo te da mas lo parte en 2 pero eso no importa ya que en el dvd no se nota... pero eso no importa...
Si lo quieres hacer es agregar los subs a los archivos .mvk tienes que hacerlo antes de la conversion...
1.- pones el archivo .mkv y el archivo .srt en una misma carpeta y con el mismo nombre (por ejemplo: si el archivo .mkv se llama Heroes.201.HDTV.XviD.LOL el sub tiene que tener el mismo nombre)
2.-abres el Convert
3.- agregas el video(s) (mkv) y el sub lo carga automaticamente
como saber si lo carga? al abrir la info del video tiene que decir: 1subtitle stream
4.- conviertes
si ese no es problema, explica lo que haces y asi t puedo guiar...